Fundación Acindar otorga becas para alumnos que hayan sido admitidos en el programa académico Especialización en organizaciones sin fines de lucro, dictado por la Universidad de San Andrés y el Centro de estudios de estado y sociedad (CEDES).
El programa de posgrado busca mejorar el desempeño de las entidades sociales mediante la formación de su personal y la realización de estudios que permitan una mayor comprensión del sector. Desde 1997 ofrece una especialización de un año de duración, seminarios y actividades de extensión.